برای محاسبه جرم اتمی از مقیاس نسبی استفاده می کنیم. مقیاس یا واحد اندازه گیری جرم \(\frac{1}{{12}}\)اتم کربن \({}_6^{12}C\) می باشد که به آن amu یا یکای جرم اتمی گویند. با تعریف جرم اتمی، دانشمندان جرم اتمی همه عناصر را نسبت به آن اندازه گیری کردند.
با توجه به اینکه در نمونه طبیعی هر عنصر ایزوتوپ های با جرم متفاوت وجود دارد، باید جرم اتمی میانگین با استفاده از فرمول زیر جرم دقیق اتم شود.محاسبه ها توسط طیف سنج جرمی اندازه شود.
جرم اتمی میانگین = \(\frac{{{m_1}{x_1} + {m_2}{x_2} + ...}}{{{x_1} + {x_2} + ...}}\)
M1 جرم اتمی ایزوتوپ 1 و M2 جرم اتمی ایزوتوپ 2
X1 درصد (تعداد) ایزوتوپ 1 و X2 درصد (تعداد) ایزوتوپ 2